Seine Funktion liegt zum einen in der Befeuchtung der Schleimhäute, damit wir z. B. gut schlucken können. Zum anderen wehrt der Schleim Keime und andere Schadstoffe aus der Luft ab. Dieser Filtermechanismus verhindert eine Ansteckung mit Krankheiten bereits zu einem großen Teil.
Feine Flimmerhärchen in der Nasen- und Bronchialschleimhaut (Lunge) sorgen täglich dafür, dass der Schleim Richtung Rachen transportiert wird, wo er unbemerkt heruntergeschluckt wird. Daher bekommen wir im Alltag meist kaum etwas von der Schleimproduktion in Hals und Nase mit.